Le laboratoire confiné de la PGTB est dédié à l’étude de l’ADN environnemental et d’échantillons « sensibles » (bois, herbier…). Ce laboratoire est équipé de salles propres à air filtré, pression positive et radiations UV. Il dispose également d’un compteur de particules pour détecter et quantifier les particules dans l’air. De plus, afin d’éviter les contaminations extérieures, le personnel et utilisateurs utilisant ces laboratoires doivent respecter des pratiques spécifiques à ce type d’analyses et porter des équipements adaptés.
Le laboratoire d’analyse ADN environnemental est isolé dans un bâtiment séparé afin d’éviter toute contamination par les laboratoires « classiques » de la PGTB. Ce laboratoire est composé d’un sas d’entrée et de 3 salles équipées d’un équipement complet en biologie moléculaire :
- une salle de préparation des échantillons (mise en tubes ou plaques, broyeur, …)
- une salle d’extraction d’ADN (extraction en tubes et plaques avec des kits commerciaux)
- une salle de préparation des mix PCR et des librairies de séquençage Illumina
Contactez-nous pour venir utiliser ce laboratoire et réaliser vos extractions, préparation de PCR ou librairies de séquençage Illumina dans des conditions optimales pour vos échantillons et vos données.
Publication associée
Salojärvi J, Rambani A, Yu Z, Guyot R, Strickler S, Lepelley M, Wang C, Rajaraman S, Rastas P, Zheng C, Muñoz DS, Meidanis J, Paschoal AR, Bawin Y, Krabbenhoft TJ, Wang ZQ, Fleck SJ, Aussel R, Bellanger L, Charpagne A, Fournier C, Kassam M, Lefebvre G, Métairon S, Moine D, Rigoreau M, Stolte J, Hamon P, Couturon E, Tranchant-Dubreuil C, Mukherjee M, Lan T, Engelhardt J, Stadler P, Correia De Lemos SM, Suzuki SI, Sumirat U, Wai CM, Dauchot N, Orozco-Arias S, Garavito A, Kiwuka C, Musoli P, Nalukenge A, Guichoux E, Reinout H, Smit M, Carretero-Paulet L, Filho OG, Braghini MT, Padilha L, Sera GH, Ruttink T, Henry R, Marraccini P, Van de Peer Y, Andrade A, Domingues D, Giuliano G, Mueller L, Pereira LF, Plaisance S, Poncet V, Rombauts S, Sankoff D, Albert VA, Crouzillat D, de Kochko A, Descombes P., 2024. The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars. Nat Genet. DOI: 10.1038/s41588-024-01695-w