Séquenceurs Oxford Nanopore

Le séquenceur GridION

Séquençage haut-débit au laboratoire

1 à 5 flow cells peuvent être utilisées en parallèle

Grande capacité de calcul pour le basecalling haute précision, l’alignement en direct ainsi que l’adaptive sampling

Le séquenceur MinION Mk1C

Tablette intégrant l’ensemble du système de séquençage pour 1 flow cell

Permet le séquençage simplifié hors du laboratoire

Basecalling haute précision en direct

Tous les séquenceurs Nanopore disponibles à la PGTB bénéficient des mêmes kits et mêmes flow cells.

Chimies / Kits

• LSK109 : maximum de débit, barcoding possible en ligation. Pour séquençage shotgun, métagénomique et amplicons

• LSK112 : maximum de qualité, barcoding possible en ligation. Pour séquençage shotgun, métagénomique et amplicons

• RBK110 : maximum de rapidité, minimum d’ADN et minimum de coût. Barcoding possible par tagmentation. Pour séquençage shotgun et métagénomique

• Kit 16S : Séquençage ciblé des communautés bactériennes

• RNA Direct : Séquençage d’ARNm natifs. Accès aux isoformes et aux bases modifiées

• cDNA : Séquençage stranded des ARNm. Accès aux isoformes

• PCR-cDNA : Séquençage stranded des ARNm. Low input, accès aux isoformes

Flow Cells 

• MinION R9.4.1 : maximum de débit

• MinION R10.4 : maximum de qualité

• Flongle (R9.4.1) : low cell bas débit. Idéale pour réaliser des tests à bas coût.