La PGTB est une plateforme technologique qui met à disposition de la communauté scientifique publique et privée ses compétences, son expertise et ses équipements de pointe dans le domaine de la génomique. Nous vous accompagnons dans la réalisation de vos projets sur mesure, en vous proposant des applications originales et un suivi personnalisé.
Nos services
SSRseq
Développement et génotypage de marqueurs microsatellites par séquençage Illumina
Développement et génotypage sur tout type d'espèces, avec ou sans génome de référence. et sur tout type de matrices, même complexes (ADNe, fèces, ...)
Metabarcoding
Analyse des régions 16S, ITS, COI, ou autres, par séquençage Illumina ou Oxford Nanopore Technologies
Illumina : taille maximale de 2x500pb et Jusqu'à 1152 échantillons dans un même run.
Oxford Nanopore : jusqu'à 384 échantillons par run
Oxford Nanopore : jusqu'à 384 échantillons par run
Génotypage SNPseq
Par séquençage Illumina, avec caractérisation des polymorphismes flanquants
95 à 1140 échantillons par analyse, sur des panels jusqu'à 192 SNP.
Séquençage ready to load
Illumina MiSeq i100 et NextSeq 2000
Délai ~ 4 semaines
Délai ~ 4 semaines
Séquençage de librairies Illumina et custom : WGS, single-cell, RNAseq, metabarcoding, métagénomique, ...
Séquençage shotgun
De novo ou reséquençage
Short-reads et long-reads
Short-reads et long-reads
Préparation et séquençage Illumina et Oxford Nanopore de librairies shotgun
Capture ADN
Chimie Agilent SureSelect sur ADN et ADN methylé
Nous vous accompagnons du design des sondes à l'analyse des données