Grâce aux développements réalisés dans le cadre du projet LABEX Cote AGIS (Analyses Génétiques In Situ), la PGTB met à disposition ses compétences dans l’accompagnement aux analyses sur le terrain portant sur :
- la détection et la quantification d’espèces cibles (espèces rares, invasives, pathogènes…) par amplification spécifique en qPCR
- la discrimination entre hybrides et espèces pures par HRM (analyse des courbes de fusion)
- la caractérisation de communautés d’organismes d’intérêt par métagénomique long read
La PGTB dispose d’équipements spécifiques de terrain comme l’extracteur d’ADN miniature PDQex de MicroGEM, la miniPCR, la PCR quantitative portable Franklin Biomeme, le séquenceur Mk1C d’Oxford Nanopore Technologies, une boite à gants mobile permettant de manipuler dans un espace clos ainsi qu’une batterie portable et un panneau solaire pour utiliser ces équipements de terrain en totale autonomie.
La Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux 