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28/03/22 : Colloque National de Génomique Végétale et Animale les 16-17-18 mai 2022 à Orléans (lire la suite)
La Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux (PGTB) est une structure académique ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique et aux acteurs industriels.
La PGTB fait partie du réseau France Génomique qui regroupe les principales plateformes de génomique au niveau national. Elle est membre de l’Infrastructure de Recherche INRAE Genomics et de la Fédération des Plateformes Labellisées de l’Université de Bordeaux. Elle elle également labellisée Plateforme stratégique par l’INRAE (CNOC) et le GIS-IBISA.
La PGTB développe et propose des services faisant appel à des technologies émergentes moyen et haut débit reposant sur le séquençage d’ADN (séquençage de courts et longs fragments d’ADN, reséquençage et métagénomique ciblée, séquençage de petits génomes et de transcriptome), la recherche et le génotypage de mutations (SNP et microsatellites), la quantification de l’expression de gènes, l’analyse d’ADN environnemental, sensible ou ancien en laboratoire confiné ainsi des services de support en matière d’analyse de biologie moléculaire courant (quantification d’acides nucléiques, contrôle de qualité, préparation de librairies, …).
Les domaines d’expertise de la PGTB
- Développement et génotypage de marqueurs microsatellites par séquençage Illumina
- Métagénomique ciblée (metabarcoding) sur séquenceur Illumina MiSeq
- Métagénomique et métatranscriptomique sur séquenceur Illumina NextSeq 2000
- DNAseq et RNAseq sur séquenceurs Illumina MiSeq et NextSeq2000
- Capture Agilent SureSelect sur ADN et ADN methylé
- Séquençage long-reads Oxford Nanopore Technologies sur GridION
- Génotypage SNP / INDEL par spectrométrie de masse sur MassArray System (Agena Biosciences)
Découvrez la PGTB en vidéo !
La Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux 